Fimea främjar människors hälsa genom att övervaka kvaliteten, säkerheten och spårbarheten hos ämnen av humant ursprung såsom blodpreparat, vävnads- och celltransplantat samt organtransplantat i Finland. Fimea övervakar dessutom de biobanker som upprätthåller samlingarna för prövningsproverna. Övervakningen omfattar förfaranden för tillstånd, registerhållning över aktörer och regelbunden inspektionsverksamhet.
Fimea behandlar anmälningar om tillbud och biverkningar för transplantat av humant ursprung samt beviljar tillstånd för medicinsk användning av mänskliga organ, vävnader och celler.